เมื่อเวลา 07:00 น วันที่ 30 มิถุนายน. พ.ต.ท มาโนช ฤทธิพูล พนักงานสอบสวนสภ. พระนครศรีอยุธยา ได้รับแจ้งเหตุพบผู้เสียชีวิตลอยน้ำจำนวน 2 รายบริเวณแม่น้ำเจ้าพระยา หน้าวัดพุทไธศวรรย์ ตำบล สำเภาล่ม อำเภอพระนครศรีอยุธยาจังหวัดพระนครศรีอยุธยาจึงรุดไปตรวจสอบพร้อมด้วย แพทย์เวรโรงพยาบาลพระนครศรีอยุธยาเจ้าหน้าที่หน่วยกู้ภัยอยุธยารวมใจ

ในที่เกิดเหตุ พบร่างผู้เสียชีวิต เป็นสามเณร 2 รูป ลอยอยู่บริเวณกลางแม่น้ำเจ้าพระยาเจ้าหน้าที่หน่วยกู้ภัยอยุธยารวมใจใช้เรือท้องแบน ร่อง เข้าไปนำร่างผู้เสียชีวิตทั้ง 2 รายเข้าฝั่งบริเวณท่าน้ำวัดพุทไธศวรรย์ จากการตรวจสอบพบเป็น สามเณร 2 รูปชื่อสามเณรนิติกร อายุ 15 ปี รายที่ 2 สามเณรกฤษดา อายุ 13 ปี ทั้ง 2 รูปสวมใส่จีวรพระสงฆ์ และลักษณะสภาพศพขึ้นอืด จากการแพทย์ชันสูตรเบื้องต้นไม่พบบาดแผลการถูกทำร้าย

จากการสอบถาม นายอุทิศ บุญจิตอายุ 64 ปี ชาวบ้าน ว่า เมื่อคืนวันที่ 28 มิถุนายนช่วงกลางดึกตนเอง เอาเรือออกหาปลาอยู่บริเวณผ่านท่าน้ำวัดกษัตราธิราชแล้วพบเห็นสามเณรกลุ่มหนึ่งเล่นน้ำอยู่บริเวณท่าน้ำหน้าววัดกษัตราธิราชวรวิหาร ตอนนั้นยังคิดอยู่เลยว่ามาเล่นน้ำกันทำไมช่วงกลางคืนเดี๋ยวจะเกิดอันตรายแต่ก็ไม่ได้ไปเตือนหรือไปห้ามจนเช้านี้ทราบว่ามีผู้พบร่างของสามเณรทั้ง 2 รูปจมน้ำเสียชีวิตจึงแน่ชัดว่าเป็นสามเณรกลุ่มเดียวที่ตนเองนั้นเห็นเมื่อกลางดึกของคืนวันก่อนอย่างแน่นอน

ทางด้าน นายอนุโรจน์ หฤทัยทิพย์อายุ 55 ปี ไวยาวัจกร วัดกษัตราธิราชวรวิหาร เดินทางมาที่เกิดเหตุ บอกว่า สามเณรทั้ง 2 รูป มาอบรม นักธรรมตรี อยู่ที่. วัดกษัตราธิราชวรวิหาร ประมาณ 2 เดือน โดย เมื่อคืนกลางดึกของวันที่ 28 มิถุนายน ได้รับแจ้งจากกลุ่มสามเณรเพื่อนว่าสามเณรทั้ง 2 รูปนั้น หายไปจากวัดแต่ก็ไม่ได้บอกว่าหายไปไหนตนเองจึงไปแจ้งความไว้ที่สภ .พระนครศรีอยุธยาว่าสามเณรทั้ง 2 รูปหายไป ตอนนั้นทางวัดเข้าใจว่าสามเณรทั้ง 2 รูปนั้นกลับไปที่วัด ต้นสังกัดเนื่องจากขอลาไปร่วมงาน ก็ไม่ได้คิดอะไร จนมาเมื่อวานทางวัดต้น สังกัด บอกว่าสามเณรไม่ได้กลับมาวัด และส่งรูปถ่ายท่าน้ำมาให้ดูว่ามีกลุ่มสามเณร 8 รูป รวมทั้งผู้สูญหายทั้ง 2 รูป ลงไปเล่นน้ำกันช่วงกลางดึกจึงได้กลับมาเค้นถามสามเณรที่เหลือในเหตุการณ์จึงยอมรับว่าลงไปเล่นน้ำกันจริงแล้วทั้ง 2 รูปได้จมน้ำหายไป จนกระทั่งช่วงเช้ามีผู้มาพบศพ

ซึ่งทางพนักงานสอบสวนได้ถ่ายรูปบริเวณจุดเกิดเหตุไว้เป็นหลักฐานก่อนจะเชิญตัวสามเณรทั้ง 6 รูปมาทำการสอบปากคำอย่างละเอียดอีกครั้งเพื่อหาสาเหตุก่อนจะ ประสานญาติของสามเณร แล้วมอบร่างให้ เจ้าหน้าที่สมาคมอยุธยารวมใจหน่วยกู้ภัยอยุธยา นำร่างส่งชันสูตรสถาบันนิติวิทยาศาสตร์จังหวัดปทุมธานีต่อไป